Ансамбль создавали постепенно. В его составе имеется холодный храм с приделами и колокольня, стоящая отдельно. Заказчиками постройки стали «гости государевой сотни», именитые участники ополчения Минина и Пожарского 1612 года. Церковь Рождества Христова построена в 1636- 1644 годах, вместо храма из дерева. Изначально – это храм с подклетом на четырёх столпах и с пятью главами, имеющий позакомарное покрытие. Он окружен с трех сторон галереями из двух ярусов, которые замыкаются с восточной стороны малыми приделами. Северо-восточный придельный зимний храм Николы-чудотворца (он являлся покровителем всех путешественников и торговцев). Главный Казанский придел построен, как четырехугольная башня с небольшой галерейкой и пристроен к у юго-западного угла храма. В завершении его ажурный крест, являющийся лучшим образцом искусства мастеров кузнечного и медного дела Ярославля. Казанский придел, посредством перехода, имел соединение с колокольней, которая была возведена в середине 17-го века.
Это уникальный шедевр, у которого нет аналогов в российской архитектуре. Одно здание состоит из Святых ворот, надвратной церкви и венчающей ее колокольни, имевшей раньше часы. Высотой колокольня - 38,34 метра. Колокольня была составной частью церковной ограды, которая окружала территорию церкви с севера и запада. Богато украшенный западный фасад её был хорошим довершением одной из городских улиц, выходящих к набережной Волги. Церковь Рождества Христова очень интересна, так как она стала первым храмом в Ярославле, в котором стены главного барабана стали украшать изразцами. Главы церкви покрыла изразцовая черепица. Храм расписали в 1680-е годы мастера и знаменщик, предположительно, - Дмитрий Семенов. Ансамбль храма Рождества Христова стал новым этапом в развитии Ярославского церковного строительства в плане композиции и декора.